Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC9O60706 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms