Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKAB2O43741 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms