Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DYNC1LI2O43237 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DYNC1LI2O43237 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DYNC1LI2O43237 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DYNC1LI2O43237 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DYNC1LI2O43237 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DYNC1LI2O43237 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DYNC1LI2O43237 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DYNC1LI2O43237 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DYNC1LI2O43237 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms