Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms