Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16■□□□□ 0.15
O00370 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16■□□□□ 0.15
O00370 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
O00370 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16■□□□□ 0.15
O00370 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
O00370 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
O00370 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms