Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM3A6NNA2 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms