Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms