Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms