Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms