Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms