Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms