Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

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Length 977 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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