Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ELL3Q9HB65 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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