Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms