Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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