Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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KRTAP1-5Q9BYS1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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KRTAP1-5Q9BYS1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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KRTAP1-5Q9BYS1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP1-5Q9BYS1 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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