Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD30BL-202ENST00000409867 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC110800.1-201ENST00000505498 441 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011773.4-202ENST00000566000 1264 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093159.2-201ENST00000603429 636 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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