Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms