Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms