Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAIPQ9BWF2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms