Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms