Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms