Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms