Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms