Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms