Protein–RNA interactions for Protein: Q86WT1

TTC30A, Tetratricopeptide repeat protein 30A, humanhuman

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC30AQ86WT1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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