Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUFY3Q7L099 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms