Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ZNF549Q6P9A3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ZNF549Q6P9A3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ZNF549Q6P9A3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ZNF549Q6P9A3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ZNF549Q6P9A3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ZNF549Q6P9A3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ZNF549Q6P9A3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ZNF549Q6P9A3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ZNF549Q6P9A3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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