Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPRIN2Q6IMN6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms