Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RTL6Q6ICC9 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RTL6Q6ICC9 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RTL6Q6ICC9 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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