Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms