Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC6LQ2NKX8 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms