Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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