Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSRP2Q16527 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms