Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms