Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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SCN9AQ15858 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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SCN9AQ15858 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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SCN9AQ15858 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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