Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms