Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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