Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms