Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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TUBA3CQ13748 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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TUBA3CQ13748 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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TUBA3CQ13748 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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TUBA3CQ13748 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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TUBA3CQ13748 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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TUBA3CQ13748 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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TUBA3CQ13748 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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TUBA3CQ13748 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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TUBA3CQ13748 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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TUBA3CQ13748 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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TUBA3CQ13748 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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TUBA3CQ13748 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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