Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms