Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CUL1Q13616 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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