Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PEX6Q13608 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PEX6Q13608 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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