Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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NAE1Q13564 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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NAE1Q13564 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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NAE1Q13564 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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NAE1Q13564 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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