Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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ATRQ13535 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ATRQ13535 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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