Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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