Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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