Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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BNIP1Q12981 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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BNIP1Q12981 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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BNIP1Q12981 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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BNIP1Q12981 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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BNIP1Q12981 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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BNIP1Q12981 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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