Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms