Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms